本剧讲述了在抗日战争最艰苦的岁月里，午夜医生杨冠雨和副县长杜松山虽身在大后方却心系战局，午夜支援前线，拯救民众，与大发国难财的腐败官僚进行斗争的故事。爱恨情仇、生死缠绵，热泪和鲜血锻造出伟大的人格。全剧波澜迭起，人物鲜明，描绘出抗战大后方一幅耐人寻味的历史画卷。1938年武汉失守，杨冠雨受国民政府委派，带着助手谢霖来到大后方玉城筹建伤兵医院，没想到玉城名医项鸿年在家中被人暗杀，由他掌管的伤兵医院巨额筹建款不翼而飞……抗日英雄副县长杜松山着手调查此案，耿直的杜松山与杨龃龉不断，却被杨发现颈椎中的残留弹片而急需手术……杜成了杨到玉城以后的第一个病人。杨冠雨与何雪珍邂逅，一见钟情，却不知何雪珍与杜松山早有婚约……为了揪出幕后黑手，杜与女共产党员方淑云演了一出苦肉计，那黑手其实就是玉城县县长骆元发，骆元发舍卒保车，县长助理老潘拒捕，被杜松山击毙。为此方淑云也付出了代价，被谴回原籍—已经沦陷了的武汉。杜为了解救方而向其求婚，而杨何也终成眷属，二对新人同日结婚，却遭遇日军空袭玉城……杨冠雨发现玉城的重重黑幕，为讨回医疗款与骆元发结仇。谢霖多年前曾受日本人引诱，签署过合作书，日本特务石原找上门来，威胁谢协助炸掉伤兵医院和炼铁厂，谢在最后的关头忏悔了，保住了伤兵医院，炼铁厂化为焦土，石原被俘自杀，谢精神几近崩溃，行踪被骆元发发现，骆利用谢的胆怯诬陷杨冠雨通敌叛国……回龙镇爆发鼠疫，杜立下生死状力保监狱中的杨冠雨出任疫情总指挥，几个月的奋战杨冠雨带着他的医疗队与死亡争分夺秒……就在制服鼠疫之时，骆派出的杀手已经悄然而至，方淑云为保护杨牺牲，留下遗腹子杜铁……岁月无痕，抗日战争已经经历了第八个年头，坚信“中国必败”的骆更加心狠手辣，而感情失意的谢霖也迁怒于杨，二人勾结起来，诬陷杨贩卖毒品，并设下圈套陷害何雪珍，杨为了保护何只得承担罪名。他坚守着医者的信念，却放弃了医生的尊严。何痛不欲生，选择了与骆同归于尽……远征军归来带来瘟疫，玉城岌岌可危，杜率军对峙一触即发，杨冠雨以人格的力量阻止了一场恶斗，杜为保护杨身中数枪，生死未卜……胜利的日子已经来临，杨冠雨在玉城的欢呼声中走向手术台，手术台上是他的兄弟、朋友、曾经的情敌、现在的战友—杜松山。